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1、相关技术不同：

蛋白质分子的结构规律及其生物功能的关系作为基础，通过化学、物理和分子生物学的手段进行基因修饰或基因合成；基因工程是核酸凝胶电泳技术、核酸分子杂交技术、细菌转化转染技术、DNA序列分析技术、寡核苷酸合成技术、基因定点突变技术、聚合酶链反应技术。

2、物质运用不同：来源:https://faiemp.cn/xwzx/202412-69.html

蛋白质工程可以制造一种新的蛋白质；基因工程只能利用已有的现实中已存在的基因来源:https://faiemp.cn/cshi/202501-178.html。来源:https://faiemp.cn/cshi/202501-149.html

3、实施对象不同：来源:https://faiemp.cn/xwzx/202412-144.html

蛋白质工程是对于蛋白质而言的改造和制造；基因工程是在分子水平上对基因进行操作的复杂技术。来源:https://www.ewtuny.cn/xwzx/202412-69.html

扩展资料：

基因工程的应用：

1、美国新泽西州圣巴纳巴斯医学中心生殖医学科学研究所的科学家，利用一项新技术改造了遗传给下一代的基因，制造出30个健康的转基因宝宝。

然而，英国获得了首个将“三亲婴儿”商业化的许可证。英国一家生育诊所获准执行“三母婴儿”技术，该技术可以防止遗传疾病通过三种父母遗传给孩子。

2、美国FDA（美国食品药品监督管理局）批准了第一个活体基因疗法，这是一个具有里程碑意义的事件，将对转基因用在医疗上产生积极的影响来源:https://ewtuny.cn/bkjj/202412-29.html。这项疗法是一个治疗儿童白血病的方案，主要内容是通过基因改造，使患者自身的血红细胞转化为癌细胞杀手来源:https://ewtuny.cn/xwzx/202412-61.html。

两个月后，FDA又批准了一项针对恶心淋巴瘤细胞疗法。这是从根本上改变过去的治疗方式，调整改变人体自身机能来对抗癌细胞的新创举，为人类利用基因改造技术治疗难治之症开辟了道路。

百度百科-蛋白质工程

百度百科-基因工程

坏处：一、克隆人违背了伦理学的不伤害原则 伤害了被克隆者。被克隆的是另外一个个体，这个个体是与克隆的原体完全独立的另外一个行为主体，这个主体受到了伤害。受到了什么伤害呢？首先从技术可能性的情况来看，我们无法预知，如果对某一种在功能上与其他基因紧密相连的基因进行干预性改变，生物体内的这种自然的相互牵制的系统会发生何种连锁反应。而根据目前掌握的知识，要想将人类基因组的所有基因重新进行准确的排列，并使之正常的发挥作用，是根本不可能做到的。恰恰是这一点构成了人们反对克隆人的一个重要理据。因为谁也无法排除这样一种风险：克隆技术很有可能导致大量的流产与残障婴儿。 二、克隆人违背了伦理学的平等原则 在克隆活动中，存在一个设计者与被设计者的关系来源:https://www.faiemp.cn/bkjj/202412-65.html。在克隆人活动中，未来人类的基因配置是由父母、医生或国家决定的，而个体的人仅仅是前者所决定与创造的结果。我们知道，设计是以设计者为前提的，一个有着设计者与被设计者之别的人类图景，对于平等原则是一种基本的违背来源:https://www.faiemp.cn/zhishi/202412-132.html。因为人们无法回答凭什么他自己或者任何别的一个人有权作为未来人类特征与品性的设计者。显然这里存在着一种“道德优越感”，似乎我们，或者说一个医生、哲学家、国家的行政长官拥有着一种控制他人的实力。然而这种心态不单是荒谬的，而且在政治上也是非常危险的。

三、克隆人违背了伦理学的自主原则 克隆人活动往往发生在下述情况中：比如，某对夫妇在事故中失去了独生子，他们希望他重获“新生”，于是便通过克隆技术再制造一个孩子，其身体中的绝大部分基因组是先前那个孩子的基因组的复制来源:https://www.ewtuny.cn/zhishi/202412-28.html。这样尽管父母在一定程度上满足了某种欲望，但这整个行为方式对于被复制的孩子而言却意味着一种外来的决定，它将该儿童本属于偶然性的那部分自由（所谓自主原则，就体现在这种自由上）剥夺了，而人的一个最重要的本质特性，就体现在他的不可重复的独特性上。德国著名哲学家忧那思说，人的一个特殊的优先权就在于，每个人都有其自身的不可重复的特性。上述的那对夫妇因为太喜欢第一个孩子，就不生第二个孩子，而是克隆第二个孩子，生出的第二个孩子可能与第一个孩子的外形都不太一样，而克隆出来的却与第一个孩子没有太大差别，等于是让他“新生了”。可见第二个孩子完全是为了服从于父母的某种意图，作为父母的一个工具，父母通过他想起他们失去的那个孩子。而被克隆者作为人应享有的独特性便被剥夺了，他的那种不必非要有一个比他大30或60岁的同体同貌者的自由，便被粗暴地践踏了。假如人们都完全可以按照自己的意志设计和培育后代，那么什么恐怖的事情都可能发生来源:https://ewtuny.cn/cshi/202501-184.html。耳聋的父母选择生下耳聋的胎儿，而这个胎儿很可能希望自己是一个健康人，但这已经做不到了。他作为一个人所天然应有的一种开放的前途的权利被粗暴否定掉了。这当然违背了伦理学的一个最基本的原则。来源:https://faiemp.cn/zhishi/202412-49.html

好处：

在医学领域中，克隆技术除了只要以外，其它方面也具有十分诱人的前景。美国，瑞士等国已经能利用克隆技术培植的人体皮肤进行植皮手术。曾经有一位美国妇女在一次煤气炉意外爆炸中受伤，75%的体表被严重烧伤。医生取下一小块未遭损坏的皮肤，送到一家生化科技公司。一个月以后，该公司利用先进的克隆技术，培植出了一大块健康的新皮肤，使患者迅速得以痊愈。这一全新技术避免了异体植皮可能出现的排异反应，给人类带来了福音。科学家们预言，在不久的将来，他们还将借助克隆技术制造出人的耳朵、软骨、肝脏，甚至心脏，动脉等人体组织和器官，供医院临床使用。

在繁殖许多有价值的基因方面，克隆技术是也有大用武之地。例如，在基因工程操作中，科学家们为了让细菌等微生物“生产”出名贵的药品，如有希望使侏儒症患者重新长高的生长激素以及能抗多种病毒感染的干扰素等等，分别将一些相应的人体基因转移到不同的微生物细胞中，再设法使这些微生物细胞大量繁殖。与此同时，人体基因数目也随着微生物的繁殖而增加。在人体基应被大量克隆时，微生物也随之大量的“生产”出人们所需要的名贵药品了。

在基础生命科学方面，克隆技术使得对基因功能研究从以往只能在小鼠身上进行，到现在在多种动物身上均可得到实现，这有利于更加清晰地揭示基因功能和生命本质；克隆技术提供了研究哺乳动物细胞发育全能型以及核质关系最有效的手段之一；克隆技术可以克隆出各种濒临珍稀动物，从而提供基因型完全一致的实验动物，这有利于找到疾病的有效治疗方法，揭示发病的机制，并有助于抗衰老及其机制的研究。

在园艺业和畜牧业中，克隆技术是选育遗传性支稳定的优质果树和良种家畜的理想手段。有了克隆技术，保持优良品种的水果就变得十分简单：只要对遗传性质稳定的优质果树进行克隆，那么，由此生产的水果便于上一代一样基本不会退化，这时 “保证质量”将不再是一句空话了。

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